水稻研究所设有水稻遗传、杂种优势利用、生物技术、品质改良、种子工程、栽培和生理7个研究团队。其中，教学科研人员35人，实验助理、科研助理和工勤人员31人。在岗科研人员中，教授14人、副教授13人，具有博士学位的35人。现有国家杰出青年科学基金获得者1人，长江学者青年学者1人，国家百千万人才工程国家级人选2人，享受国务院政府特殊津贴专家4人，四川省科技杰出贡献奖获得者1人，天府万人计划人才2人，四川省学术和技术带头人8人，四川省有突出贡献的优秀专家3人。拥有农业部“长江上游水稻种质改良与创新利用”团队、四川省青年科技创新研究团队、水稻遗传育种四川省国际科技合作基地和四川省劳模创新工作室。
研究团队成员如下表，更多详情请参见“研究团队”。
| 研究团队 | 成 员 |
| 水稻遗传研究团队 | 科研人员：吴先军、张红宇、徐培洲、陈晓琼、廖泳祥、周浩、杜康兮 科研助理：田芸峰 科研辅助：高晓彬、杨洪松、高克富、郑建国、向光荣、罗泉兴、姜建连 |
| 水稻杂种优势利用研究团队 | 科研人员：李仕贵、钦鹏、王玉平、马炳田、 涂斌、 陈薇兰、 袁华、仲昭辉、熊佳威 科研助理：康亮珠、唐诗闻 科研辅助：李文革、李文华、王永建、杨世琼、张大海、袁亮 |
| 生物技术研究团队 | 科研人员：李平、李双成、 邓其明、王世全、刘怀年、朱军、梁越洋、邹挺 科研助理：金京花 |
| 品质改良研究团队 | 科研人员：邓晓建、王平荣、孙昌辉 科研辅助：杨斌 |
| 种子工程研究团队 | 科研人员：朱建清 科研助理：叶小英、贾晓梅 科研辅助：罗永财、李光成 |
| 水稻栽培研究团队 | 科研人员：马均、孙永健、杨志远、陈宗奎 科研辅助：李彪 |
| 水稻生理研究团队 | 科研人员：徐正君、陈荣军、李利华 科研辅助：黄正建 |