| 编号 | 姓名 | 专业 | 论文题目 | 导师 | 获奖级别 | 获奖年度 | 
| 1 | 李仕贵 | 作物遗传育种 | 水稻几个重要性状的遗传分析和分子标记定位 | 周开达 | 全国百篇优秀博士学位论文 | 2000 | 
| 2 | 欧阳鑫昊 | 作物遗传育种 | 拟南芥转录因子FHY3全基因组绑定位点分析及参与叶绿体分裂的调控机制 | 李仕贵 | 四川省优秀博士学位论文 | 2013 | 
| 3 | 朱紫薇 | 作物遗传育种 | 水稻bsr-d1对稻瘟病抗性的调控机制研究 | 李伟滔 | 四川农业大学优秀博士学位论文 | 2022 | 
| 4 | 张 霞 | 作物遗传育种 | 水稻粒型与胁迫相关基因LG1的克隆与功能分析 | 李仕贵 | 四川农业大学优秀博士学位论文 | 2021 | 
| 5 | 胡 丽 | 作物遗传育种 | 丙酮酸激酶复合体调控水稻籽粒灌浆的分子机制研究 | 李仕贵 | 四川农业大学优秀博士学位论文 | 2020 | 
| 6 | 黄衍焱 | 植物病理学 | 自我调节的核质穿梭决定RPW8.2介导的细胞死亡和抗病性 | 王文明 | 四川农业大学优秀博士学位论文 | 2019 | 
| 7 | 梁越洋 | 生物化学与分子生物学 | 独脚金内酯信号靶蛋白SMXL7调控拟南芥地上株型 | 李平 | 四川农业大学优秀博士学位论文 | 2018 | 
| 8 | 赵俊茗 | 作物遗传育种 | 水稻抽穗期相关基因OsELF3-1的功能研究和Osa-miR393a在多年生草坪草的应用 | 李仕贵 | 四川农业大学优秀博士学位论文 | 2018 | 
| 9 | 杜安平 | 作物遗传育种 | 转录因子DTH8抑制开花的分子机制及其在杂交水稻育种中的应用 | 李仕贵 | 四川农业大学优秀博士学位论文 | 2017 | 
| 10 | 周晓钢 | 作物遗传育种 | 水稻非小种特异性抗性突变体bsr-k1的基因克隆与分子机制研究与四个类受体胞内激酶参与调节水稻生长发育与免疫反应的研究 | 陈学伟 | 四川农业大学优秀博士学位论文 | 2017 | 
| 11 | 李文博 | 作物遗传育种 | PTB1基因控制水稻结实率的分子机制及其调控网络 | 李平 | 四川农业大学优秀博士学位论文 | 2016 | 
| 12 | 涂斌 | 作物遗传育种 | 木聚糖水解酶基因OsXYN1的功能解析及两个核苷酸转移酶介导miRNA降解的研究 | 李仕贵 | 四川农业大学优秀博士学位论文 | 2015 | 
| 13 | 丁 磊 | 生物化学与分子生物学 | 水稻纹枯病菌蛋白质互作网络模型的建立及致病转录因子STE12的克隆与功能验证 | 李平 | 四川农业大学优秀博士学位论文 | 2014 | 
| 14 | 杜柏娟 | 生物化学与分子生物学 | int突变能够增强不同温度下抗病基因诱导的生长缺陷 | 徐正君 | 四川农业大学优秀博士学位论文 | 2013 | 
| 15 | 欧阳鑫昊 | 作物遗传育种 | 拟南芥转录因子FHY3全基因组绑定位点分析及参与叶绿体分裂的调控机制 | 李仕贵 | 四川农业大学优秀博士学位论文 | 2012 | 
| 16 | 余秀梅 | 作物遗传育种 | 有益农用微生物资源鉴定和相关基因的克隆及其功能验证 | 李平 | 四川农业大学优秀博士学位论文 | 2012 | 
| 17 | 朱 军 | 生物化学与分子生物学 | 四川盆地散云金牙脆杆菌cry和cyt基因的鉴定及其新型模式cry基因研究 | 李平 | 四川农业大学优秀博士学位论文 | 2011 | 
| 18 | 王平荣 | 作物遗传育种 | 水稻824ys黄绿叶突变基因的图位克隆及功能分析 | 邓晓建 | 四川农业大学优秀博士学位论文 | 2011 | 
| 19 | 林 郸 | 农艺与种业 | 不同轮作模式下水稻季氮肥运筹对杂交籼稻产量、氮素利用特征及米质的影响 | 孙永健 | 四川农业大学优秀硕士学位论文 | 2022 | 
| 20 | 李续濮 | 植物病理学 | 水稻miR162a调控稻瘟病抗性的初步研究 | 李燕 | 四川农业大学优秀硕士学位论文 | 2020 | 
| 21 | 曹小龙 | 植物病理学 | 水稻miR398b调控基础免疫的初步研究 | 王文明 | 四川农业大学优秀硕士学位论文 | 2019 | 
| 22 | 周 练 | 作物遗传育种 | 两个抗病相关基因平衡水稻产量和抗性分子机制的初步研究 | 陈学伟 | 四川农业大学优秀硕士学位论文 | 2019 | 
| 23 | 石 辉 | 作物遗传育种 | 水稻转录因子IPA1和激酶OsBSK1-2对水稻免疫反应的调控作用 | 陈学伟 | 四川农业大学优秀硕士学位论文 | 2018 | 
| 24 | 赵胜利 | 植物病理学 | Osa-miR169调控水稻对稻瘟病菌免疫机理的研究 | 王文明 | 四川农业大学优秀硕士学位论文 | 2017 | 
| 25 | 杨 娟 | 植物病理学 | 稻曲病菌侵染水稻无雄蕊突变体的显微结构分析及激活水稻灌浆相关基因的初步研究 | 王文明 | 四川农业大学优秀硕士学位论文 | 2016 | 
| 26 | 严奉君 | 作物栽培学与耕作学 | 秸秆覆盖与水氮管理对水稻产量与米质及土壤理化性质的影响 | 孙永健 | 四川农业大学优秀硕士学位论文 | 2015 | 
| 27 | 余宗兰 | 植物病理学 | 杀鳞翅目害虫新基因的克隆与功能研究 | 郑爱萍 | 四川农业大学优秀硕士学位论文 | 2015 | 
| 28 | 任 云 | 生物化学与分子生物学 | 一个水稻小粒矮秆突变体的遗传分析与基因定位 | 李平 | 四川农业大学优秀硕士学位论文 | 2014 | 
| 29 | 卢远根 | 植物病理学 | 水稻中与水稻-稻瘟病菌互作相关的microRNA初步研究 | 王文明、李 燕 | 四川农业大学优秀硕士学位论文 | 2014 |